目录
蛋白数据下载
①蛋白数据下载
1，TCGA-选择泛癌数据
2，TCGA-TCPA
3，CPTAC(非TCGA)
②蛋白相关性分析
1，数据整理
2，蛋白相关性分析
PCAS在线分析
蛋白数据下载
CPTAC蛋白组学数据库介绍及数据下载分析 – 王进的个人网站 (jingege.wang)
①蛋白数据下载
可以下载泛癌蛋白数据：UCSC Xena (xenabrowser.net)
1，TCGA-选择泛癌数据
dataset: protein expression - RPPA进行数据下载
https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/TCGA-RPPA-pancan-clean.xena.gz; Full metadata
蛋白数据为标准化后的数据，存在负值。
| TCGA-FI-A2EY-01 |
TCGA-DF-A2KS-01 |
TCGA-A5-A1OH-01 |
TCGA-AX-A2H7-01 |
TCGA-AX-A2HA-01 |
TCGA-A5-A2K4-01 |
TCGA-EY-A2OM-01 |
TCGA-EY-A2ON-01 |
TCGA-E6-A2P8-01 |
TCGA-E6-A2P9-01 |
| ACC1 |
2.375 |
0.5006 |
-0.2345 |
0.4286 |
-1.098 |
-0.6596 |
0.05107 |
-0.8085 |
-0.04372 |
-0.5503 |