个人技术分享

参考：
https://310.ai/copilot

可以通过自然语言对话形式实现小分子、蛋白质的相关处理：生成序列、折叠等

应该是agent技术调用不同工具实现

1. 从UniProt数据库中搜索和加载蛋白质。
2. 使用ESM Fold方法折叠蛋白质。
3. 使用310.ai基础模型设计新蛋白质。
4. 使用TM-Align方法比较蛋白质。
5. 利用ProteinMPNN模型进行蛋白质逆折叠。
6. 聚焦并可视化蛋白质结构的特定部分。
7. 生成报告并导出结果。 例如： - 查找结合锌且序列长度小于300的蛋白质。 - 折叠序列"DIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQ"。 - 设计包含特定功能的新蛋白质。 - 比较两个或多个蛋白质。 - 使用ProteinMPNN重新设计蛋白质。 - 高亮显示特定残基范围。 - 导出结果报告。

在线体验：

https://310.ai/copilot

小分子查找

蛋白质PDB查找

ProteinMPNN生成蛋白质序列

ESMFold进行蛋白序列的折叠<